Franz Müntefering (07.12.1999–20.10.2002)
Olaf Scholz (20.10.2002–21.03.2004)
Klaus-Uwe Benneter (21.03.2004–15.11.2005)
Hubertus Heil (seit 15.11.2005)
Seit 1999 gibt es das Amt des Generalsekretär. Dazu wurde Paragraph § 24 (1) der Satzung wie folgt geändert: "Der Generalsekretär oder die Generalsekretärin führt die Geschäfte der Partei im Einvernehmen mit dem/ der Vorsitzenden und dem Präsidium im Einklang mit den Beschlüssen des Parteivorstandes. Der Generalsekretär oder die Generalsekretärin koordiniert die Parteiarbeit, leitet die Parteizentrale und ist für die Vorbereitung und Durchführung der Bundestagswahlkämpfe zuständig. Der Generalsekretär oder die Generalsekretärin bestellt im Einvernehmen mit dem Parteivorstand den Bundesgeschäftsführer/ die Bundesgeschäftsführerin."